肾细胞癌（RCCs）明显多样化，包括20多种不同的亚型，通常分为透明细胞型和非透明细胞型；大约20%的RCCs属于非透明细胞RCCs（非ccRCC）类别，许多亚型极为罕见，没有得到广泛研究。尽管非ccRCCs的分子特征各不相同，但它们通常采用针对更普遍的透明细胞类型设计的疗法进行治疗，这会影响治疗的有效性。由于重叠的形态学特征和当前生物标志物缺乏特异性，非ccRCC肿瘤的鉴别诊断带来了重大挑战。一项研究现在发现了RCCs中的新生物标志物，可以提高诊断的准确性，并有可能改善治疗策略。这项研究采用了一种综合方法来检查cc和非cc RC的综合蛋白基因组数据，推进了以前以基因组为重点的研究，并加深了对肾细胞癌驱动机制的理解。这些发现为识别非ccrc的潜在治疗靶点提供了基础。
这项研究由密歇根大学（美国密歇根州安娜堡）领导，是临床蛋白质组肿瘤分析联合会（CPTAC）的一部分，该联合会是一个美国研究小组，致力于通过广泛的蛋白质组和基因组分析来了解癌症的分子基础。该联盟使研究人员能够整合肿瘤的基因组和蛋白基因组数据，促进了本研究中使用的大规模分析。利用CPTAC的高质量样本，该团队生成了各种数据类型，并通过密歇根大学开发的多条管道进行了分析。这项研究建立在先前对RCCs的研究基础上，特别关注蛋白质分析。该团队此前曾领导过另外两项CPTAC关于cc RCC蛋白基因组学的研究；这些研究评估了213名患者（305个肿瘤和166个良性肾组织），确定了cc RCC的潜在生物标志物和治疗靶点。
这项研究将重点转移到非ccRCC，检查了48名患者（48例肿瘤和22例良性肾组织）。总之，这些研究已经创建了一个广泛的RCC蛋白基因组数据库，该数据库现在将成为未来研究的宝贵公共资产。研究人员比较了ccRCC和非ccRCC肿瘤的蛋白基因组、代谢组学和翻译后修饰谱，包括几种罕见的亚型。他们对这些多组学数据进行了综合分析，以彻底了解这些不同RCC亚型的疾病机制。详细的分析揭示了cc和非cc RCC肿瘤共同的分子特征，以及不同非ccRCC亚型特有的独特特征和遗传不稳定性标记，这些特征与生存率降低相关。
发现显示显著基因组不稳定性的RCCs过表达IGF2BP3和PYCR1。这些生物标志物现在可以用于验证独立患者队列中的发现，并最终开发可以检测基因组不稳定性的分析方法，帮助识别风险较高的患者，并允许医疗保健提供者根据患者的个人需求定制治疗计划。该研究还确定了用于鉴别诊断的生物标志物，可以区分恶性和良性肿瘤。这些诊断生物标志物可以集成到现有的测试面板中，以提高诊断精度。此外，将单细胞的RNA测序与大量转录组数据相结合，可以预测各种肿瘤类型的起源细胞，并阐明了不同RCC亚型的蛋白基因组特征。总的来说，这些见解大大提高了研究人员准确诊断各种RCC亚型（包括几种罕见变异）的能力，并识别高风险患者，从而优化他们的治疗策略。
密歇根医学转化病理学中心的副研究科学家Saravana Mohan Dhanasekaran帮助领导了这项研究，他表示：“罕见的癌症往往被排除在主要的分析工作之外，因此这一领域的治疗和诊断进展有限。到目前为止，没有一个中心有足够的样本来进行全面的多组学分析。我们的研究通过表征高质量、罕见的肿瘤标本，提供了有用的公共数据资源，为罕见的癌症社区日益增长的努力做出了重大贡献。”

来源：
https://www.labmedica.com/molecular-diagnostics/articles/294801112/novel-biomarkers-to-improve-diagnosis-of-renal-cell-carcinoma-subtypes.html

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