机器学习模型计算癌症患者化疗成功率

2024-01-06 来源: drugdu 186

坏死百分比(PN)——化疗后被视为无效或“死亡”的肿瘤比例——的计算是癌症骨肉瘤生存结果的重要预测指标。例如,99%的PN表示99%的肿瘤已经死亡,表明患者对化疗的积极反应和潜在的更好的生存前景。病理学家通常通过仔细检查、解释和标记全玻片图像(WSI)来评估PN,全玻片图像是为显微镜检查准备的标本(如骨组织)的详细横截面。然而,这种传统方法不仅耗时且需要专业知识,而且观察者之间的差异也很大。这意味着两位病理学家可能会报告来自同一WSI的不同PN估计。现在,一个为计算PN而创建和训练的机器学习模型表明,与肌肉骨骼病理学家的结果相比,其计算正确率为85%,排除异常值后,准确率提高到99%。
约翰斯·霍普金斯医学院(美国马里兰州巴尔的摩)的一个研究团队正在开发一种“弱监督”机器学习模型,该模型不需要大量的注释数据进行训练。通过这样做,病理学家只需要提供部分注释的WSI,大大减轻了他们的工作量。为了开发机器学习模型,该团队首先从2011年至2021年间接受化疗和手术的髓内骨肉瘤(起源于骨骼内)患者中收集WSI。然后,肌肉骨骼病理学家在这些WSI上部分标记了三种组织类型:活动肿瘤、死亡肿瘤和非肿瘤组织,并提供了每个病例的PN估计值。这些数据为模型的训练奠定了基础。
对模型进行了识别和分类图像模式的训练。WSI被分成数千个较小的斑块,根据病理学家的标签分组,然后输入模型。这一过程旨在为模型提供一个更稳健的参考框架,而不仅仅是为其提供一个大型的WSI。训练完成后,该模型与肌肉骨骼病理学家一起对两名患者的六个WSI进行了测试。结果表明,模型和病理学家之间的PN计算和组织标记具有85%的相关性。然而,该模型难以准确标记软骨,导致一个WSI上软骨丰富,从而出现异常。当这个异常值被去除后,相关性飙升至99%。未来的工作将集中在将软骨组织纳入模型的训练中,并扩大WSIs的范围,以涵盖各种骨肉瘤类型,而不仅仅是髓内骨肉瘤。
该研究的第一作者之一、约翰斯·霍普金斯医学院整形外科住院医师克里斯塔·利布里齐医学博士表示:“如果这个模型得到验证和生产,它可以帮助加快对患者化疗有效性的评估,从而更快地对患者的预后做出估计。这将降低医疗保健成本,并减轻肌肉骨骼病理学家的劳动负担。”

来源:
https://www.labmedica.com/pathology/articles/294799814/machine-learning-model-calculates-chemotherapy-success-in-patients-with-bone-cancer.html

责编: editor
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