2024-09-12 来源: drugdu 134
重磅!DeepMind又放大招!
AlphaFold 在蛋白质预测领域一骑绝尘,AlphaFold 3 更是突破限制,实现了所有生命分子的预测,其发布时便有声音称,AlphaFold 3 的结构化预测与生成将加速AI驱动药物设计的发展。
如今,DeepMind 又放大招——发布用于新型蛋白质设计的 AlphaProteo
AlphaProteo是首个专为设计新型高强度蛋白质结合物的AI系统,它可以生成多种目标蛋白的结合物。该系统显著提升了成功率,甚至比现有方法强3至300倍。尤其是针对与癌症和糖尿病并发症相关的VEGF-A蛋白,AlphaProteo是首个设计成功结合物的AI工具。此外,它还能有效结合多种与感染、癌症、炎症和自身免疫疾病相关的蛋白质,例如BHRF1、SARS-CoV-2尖刺蛋白、IL-7Rɑ、PD-L1、TrkA和IL-17A等
AlphaProteo 成功设计了 7 个靶标的蛋白结合剂。包括两种病毒蛋白,BHRF1 和 SARS-CoV-2 刺突蛋白受体结合域 SC2RBD;以及 5 种参与癌症、炎症和自身免疫性疾病的蛋白,SC2RBD、IL-7Rɑ、PD-L1、TrkA、IL-17A 和 VEGF-A。实现了更高的实验成功率和比现有最佳方法高 3 到 300 倍的结合亲和力
对于 BHRF1 ,在 Google DeepMind Wet Lab 中进行测试时,88% 的候选分子成功结合。根据测试的靶标,AlphaProteo 结合剂的结合力平均比现有最佳设计方法强 10 倍;对于另一个靶标 TrkA,该团队设计的结合剂甚至比经过多轮实验优化的针对该靶标的最佳先前设计的结合剂更强!
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