下一代食管DNA检测可提高检测性能并降低成本

2023-12-16 来源: drugdu 114

慢性胃灼热可能表明巴雷特食管(BE),这是一种癌前病变,食道内壁因消化液而受损。虽然BE本身没有表现出症状,但它显著增加了患食管腺癌(EAC)的风险,这是一种危险的癌症。许多患有BE的人不知道他们的病情,因此,他们的癌症风险升高。及时识别BE和癌前细胞对于有效监测和干预,防止进展为致命的癌症至关重要。现在,在综合验证研究中,一种检测食管癌前病变的先进测试已经证明了检测效率和成本效益的提高。
Lucid Diagnostics(美国纽约州纽约市)推出了下一代EsoGuard食道DNA测试EsoGuard2.0。EsoGuard测试首先从使用EsoCheck细胞采集设备采集的食道细胞中提取DNA。这种DNA经过亚硫酸氢盐转化,标记未甲基化的位点。然后重点研究了VIM和CCNA1两个基因,确定了与食管癌前病变和癌症相关的31个甲基化位点。这些位点使用聚合酶链式反应(PCR)进行扩增,并通过下一代测序(NGS)方法进行测序。然后,复杂的生物信息学软件分析这些序列数据,计算31个靶位点的甲基化比例,得出阳性或阴性的EsoGuard结果。
最初的检测版本采用了一种单一的复合方法,由于DNA的分裂,每个基因都被单独处理。EsoGuard 2.0创新了多路复用方法,允许同时分析单个DNA样本中的两个基因。这一进步使实验室能够进行三次检测,获得阳性和阴性结果的一致性,从而减少接近阈值的低阳性样本的误差。下一代分析已经经过了广泛的分析和临床验证,包括根据CLIA标准,将多重一式三份的一致性与单一多重方法进行直接比较。其临床验证包括ESOGUARD-BE-1研究的样本,显示出更高的敏感性和特异性。
Lucid董事长兼首席执行官、医学博士Lishan Aklog表示:“EsoGuard 2.0在多个方面改进了EsoGuard1.0已经非常出色的性能,包括提高DNA产量、简化包含先进分子技术和更高效生物信息学的下游流程,以及实现更高吞吐量的测试。这些改进还降低了检测的每样本成本,我们预计在未来几个月内,当我们将NGS测序平台升级到更高吞吐量的模型,以适应不断增加的EsoGuard检测量时,这一成本将进一步降低。”

来源:
https://www.labmedica.com/molecular-diagnostics/articles/294799585/next-gen-esophageal-dna-test-offers-enhanced-assay-performance-and-lower-costs.html

责编: editor
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